Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRP8O43159 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRP8O43159 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRP8O43159 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRP8O43159 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRP8O43159 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRP8O43159 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRP8O43159 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRP8O43159 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRP8O43159 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRP8O43159 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRP8O43159 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRP8O43159 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRP8O43159 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP8O43159 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP8O43159 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP8O43159 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP8O43159 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP8O43159 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP8O43159 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRP8O43159 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRP8O43159 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRP8O43159 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRP8O43159 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRP8O43159 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP8O43159 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP8O43159 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP8O43159 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP8O43159 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRP8O43159 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRP8O43159 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RRP8O43159 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RRP8O43159 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRP8O43159 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRP8O43159 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRP8O43159 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRP8O43159 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RRP8O43159 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRP8O43159 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRP8O43159 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RRP8O43159 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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