Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SOCS1O15524 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOCS1O15524 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOCS1O15524 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms