Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIN2DO15399 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2DO15399 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms