Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FFAR3O14843 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FFAR3O14843 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FFAR3O14843 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FFAR3O14843 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FFAR3O14843 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FFAR3O14843 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FFAR3O14843 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FFAR3O14843 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FFAR3O14843 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FFAR3O14843 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FFAR3O14843 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms