Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN9O14815 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN9O14815 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN9O14815 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms