Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP2O00295 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP2O00295 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP2O00295 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP2O00295 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP2O00295 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP2O00295 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP2O00295 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP2O00295 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP2O00295 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP2O00295 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP2O00295 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP2O00295 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP2O00295 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP2O00295 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP2O00295 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP2O00295 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP2O00295 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP2O00295 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP2O00295 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP2O00295 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP2O00295 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP2O00295 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP2O00295 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP2O00295 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP2O00295 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP2O00295 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP2O00295 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP2O00295 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP2O00295 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP2O00295 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP2O00295 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP2O00295 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP2O00295 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP2O00295 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TULP2O00295 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP2O00295 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP2O00295 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP2O00295 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP2O00295 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP2O00295 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP2O00295 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TULP2O00295 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP2O00295 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP2O00295 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP2O00295 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP2O00295 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP2O00295 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP2O00295 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP2O00295 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP2O00295 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP2O00295 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TULP2O00295 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TULP2O00295 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP2O00295 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP2O00295 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TULP2O00295 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms