Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFXAPO00287 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFXAPO00287 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms