Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN8O00124 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms