Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NPIPB9F8W1W9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPIPB9F8W1W9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPIPB9F8W1W9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms