Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9IYK1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9IYK1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9IYK1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9IYK1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9IYK1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9IYK1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C9IYK1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C9IYK1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9IYK1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C9IYK1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9IYK1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9IYK1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9IYK1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9IYK1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C9IYK1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9IYK1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9IYK1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9IYK1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9IYK1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9IYK1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9IYK1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9IYK1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C9IYK1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9IYK1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9IYK1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C9IYK1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9IYK1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9IYK1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9IYK1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9IYK1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9IYK1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9IYK1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9IYK1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9IYK1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C9IYK1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9IYK1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9IYK1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9IYK1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
C9IYK1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9IYK1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9IYK1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9IYK1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9IYK1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9IYK1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9IYK1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9IYK1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9IYK1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9IYK1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9IYK1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9IYK1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9IYK1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9IYK1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9IYK1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9IYK1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9IYK1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9IYK1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9IYK1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9IYK1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms