Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ISM1B1AKI9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ISM1B1AKI9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISM1B1AKI9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms