Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf47A7E2U8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4orf47A7E2U8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4orf47A7E2U8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms