Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDR42E2A6NKP2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDR42E2A6NKP2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDR42E2A6NKP2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms