Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
PCNX2A6NKB5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNX2A6NKB5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms