Protein–RNA interactions for Protein: A6NGE7

URAD, Putative 2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URADA6NGE7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
URADA6NGE7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
URADA6NGE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URADA6NGE7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms