Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL33A6NCF5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL33A6NCF5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms