Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SSPOA2VEC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SSPOA2VEC9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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