Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIPSLA2A3N6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIPSLA2A3N6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms