Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVM2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVM2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms