Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms