Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms