Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCAF1Q9Y4C2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TCAF1Q9Y4C2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCAF1Q9Y4C2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCAF1Q9Y4C2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCAF1Q9Y4C2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TCAF1Q9Y4C2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms