Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TBCCD1Q9NVR7 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms