Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms