Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHOXF2Q9BQY4 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms