Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms