Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PFDN5Q99471 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms