Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDAC11Q96DB2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms