Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GTF3C6Q969F1 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GTF3C6Q969F1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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GTF3C6Q969F1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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GTF3C6Q969F1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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GTF3C6Q969F1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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GTF3C6Q969F1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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GTF3C6Q969F1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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GTF3C6Q969F1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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