Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SVOPQ8N4V2 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms