Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNE4Q8N205 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNE4Q8N205 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms