Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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