Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms