Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms