Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FXNQ16595 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FXNQ16595 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FXNQ16595 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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