Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GAPVD1Q14C86 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GAPVD1Q14C86 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms