Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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