Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA7Q13683 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA7Q13683 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms