Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ATRQ13535 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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