Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AP3B2Q13367 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AP3B2Q13367 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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