Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms