Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms