Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA8P48165 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA8P48165 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms