Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms