Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRDP23468 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRDP23468 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRDP23468 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRDP23468 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRDP23468 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRDP23468 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRDP23468 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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