Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms