Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA2O43364 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms