Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LRRTM2O43300 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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