Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TO15178 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TO15178 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TO15178 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TO15178 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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