Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPRTO14522 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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